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如果按照结构来划分就分为DNA药物和RNA药物，再继续细分就有反义寡核苷酸和小干扰RNA，小RNA、短发卡RNA、 信使RNA、质粒DNA、适配体、核酶及脱氧核酶等。
质粒DNA目前用的最多的还是兽用疫苗，人用产品还仅仅停留在临床试验阶段。
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