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美迪西专访 | 新药研发智在必行:听任峰博士畅谈AI制药的无畏前行

2024-06-13
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在人工智能的迅猛发展趋势下,AI在药物研发领域的应用正逐渐改变传统医药产业格局,推动着药物研发朝着更快、更强、更精准的方向积极变革。英矽智能作为AI制药领域的佼佼者,在过去几年表现抢眼,无论是管线建设、平台技术还是出海合作,都展现了其超强的实力。

AI制药是否最终能引领新药研发取得成功?它是否能通过算法数据等方式有效加速药物研发进程?美迪西作为英矽智能的合作伙伴,有幸邀请英矽智能联合首席执行官兼首席科学官任峰博士,和大家一起探讨和解读人工智能在新药研发的发展和趋势。

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任峰 博士,英矽智能联合首席执行官兼首席科学官,毕业于美国哈佛大学化学系,拥有超过15年药物研发行业经验。曾任跨国药企葛兰素史克的小分子创新药物研发负责人,2018年加入上海美迪西,历任副总裁、高级副总裁,全面负责化学部和生物部的研发服务业务以及公司的药物发现平台服务业务。
2021年加入英矽智能任首席科学官,带领药物研发团队利用公司自主研发的人工智能平台构建临床前/临床产品管线和外部项目合作。2022年6月,任峰博士被任命为英矽智能联合首席执行官。任峰博士发表国际学术论文30余篇、国际专利20余件。
近日,国家药监局药品审评中心(CDE)官网公示,英矽智能开发的1类新药ISM3412获得临床试验默示许可在中国开展临床试验,适应症为晚期/转移性实体瘤。ISM3412项目也是一款中美双报的抗肿瘤项目,已于2024年4月获得美国食品药品监督管理局(FDA)批准在美国开展临床试验,用于治疗MTAP缺失癌症。

ISM3412是英矽智能自2022年以来,第7款获得临床试验批件的小分子药物。这是一款靶向MAT2A的潜在同类最佳口服小分子抑制剂,也是英矽智能在“合成致死”策略下推进的又一个抗肿瘤管线。

Q1 美迪西:MAT2A小分子抑制剂具有哪些优势?能够解决目前肿瘤治疗中的哪些痛点?

任峰博士:MTAP缺失在肿瘤中的发生概率高达15%,是肺癌、膀胱癌和胰腺癌等癌症中最常见的基因缺失之一,与患者预后不良相关。通过靶向MAT2A,我们有望调控影响细胞功能和存活的关键分子,从而对MTAP缺失的癌细胞产生选择性抗增殖作用。

ISM3412是由生成化学平台Chemistry42辅助设计的一款口服小分子抑制剂,具有“同类最佳”潜力。从临床前数据看,ISM3412表现出优异的类药性、低剂量下的强大药效、良好的溶解性和渗透性,以及优良的安全性特征。

另外,ISM3412不仅具有单药治疗潜力,在临床前研究中也表现出了和化疗等标准疗法联用的协同作用。和已知的同靶点候选药物相比, ISM3412具有更优良的治疗窗口,已有数据支持这款小分子在非小细胞肺癌、间皮瘤、食管癌、膀胱癌等疾病领域的潜力。

Q2 美迪西:英矽智能正在开发的管线建设有什么独特之处?在未来几年,可以预期英矽智能在研发管线方面有望迎来哪些里程碑进展?

任峰博士:自2021年以来,在人工智能平台的支持下,我们内部开发了30多条管线并提名了18个PCC,目前其中7个化合物拿到了临床试验批件,这些项目在纤维化、肿瘤、自免等相关疾病领域都有所涉及。

从合作项目来看,近期我们和复星医药合作的两个项目都在稳步推进中,其中临床阶段的QPCTL项目,是一个肿瘤项目,近期完成了首例患者给药,另一个合成致死的项目,也收到了复星医药的认可,双方认定提名项目的PCC,真正实现了在合作中交付成果。

从自研项目来看,今年以来我们已经提名了KIF18A的PCC,这是一款潜在同类最佳,靶向染色体不稳定的小分子抑制剂,有望用于治疗 TP53 突变的晚期实体瘤。临床方面,MAT2A项目完成IND-enabling的研究,先后在中国和美国拿到临床试验批件。我们的核心管线IPF项目也在近期完成了在中国的2a临床试验的全部患者入组,预计年内就可以披露阶段性的结果和数据。这些都是让我们非常振奋的临床前和临床里程碑。

Q3 美迪西:英矽智能建立了丰富的管线,如何保持这种高强度的推进能力的?

任峰博士:我们目前聚焦的领域有两个特点,一个是数据比较充足,可以充分展现人工智能挖掘线索和筛选潜在可能性的能力,是人工智能擅长的领域;另一个特点,我们目前选择立项的项目靶点都相对新颖,这样的项目不仅拥有较大的市场潜力避免同质化竞争,而且也可以给一些还没有疗法的疾病,比如一些进展较快的恶性肿瘤领域等,带来一些破局。

Q4 美迪西:您认为Pharma.AI,特别适合帮助什么样的企业?企业在什么阶段或者在面临哪些困境的时候Pharma.AI可以最大程度的进行帮助和合作?

任峰博士:在ChatGPT等C端的AI应用爆火之后,生成式人工智能和大语言模型(LLM)好像一夜之间飞进千行百业,但其实这些技术在医药研发领域的应用要早得多。2016年,英矽智能发布了领域第一篇采用生成对抗网络(GAN)赋能创新小分子生成的论文,并在此基础上进行上下游延展,搭建并验证了端到端赋能药物研发三大阶段的Pharma.AI平台,贯穿生物化学、临床开发领域。

在依赖研发人员经验的传统药物研发领域,靶点内卷、高成本低效率的困境持续存在。我自己在研发一线做了十几年,对此深有感触,而AI或许就是破局的利器。和人类不同,AI可以快速学习,甚至没有止境地不断迭代进步,仅仅是英矽智能自有的数据库就涵盖超10亿个数据点,比一位科学家一辈子能读的文献还要多。结合生成式人工智能、自然语言处理、Transformer等前沿AI技术,我们期待AI能对药物研发领域起到全方位的降本增效作用。

Q5 美迪西:作为AI 制药领域的佼佼者,英矽智能的核心法宝人工智能平台Pharma.AI是否还会在AI应用的哪些方面持续探索或加强自身的优势?

任峰博士:Pharma.AI平台和算法一直处在持续的拓展优化之中,基本是几个月一次小更新,半年一次大更新。目前,平台涵盖的算法有30多种,都是优中选优、多次测试的结果。去年11月,我们发布了Pharma.AI版本更新,不仅扩充了数据库、细化了数据标签逻辑,还强化了采用自然语言处理的实时问答功能,并添加了ADMET性质预测等功能应用。未来,我们期待AI技术可以赋能除生物医药之外的更多领域,也正在绿色化学和新材料方面进行探索,并达成了国际合作。

Q6 美迪西:AI制药领域的发展还处在初期阶段,机遇和挑战并存的,您认为目前我国在这条赛道竞争力如何?有哪些方面需要更加进步和提升的?

任峰博士:在AI制药赛道,中国起步相对比较晚,大部分公司集中在2016-2018年左右成立,落后了几年的时间。正是因为这个原因,海外AI制药公司率先将药物管线推进到2期临床阶段也并不奇怪。但是,依托国内高质量的尖端人才和集聚的生物医药资源优势,我们有可能,甚至已经实现了弯道超车。举例来说,英矽智能领先的抗纤维化小分子靶向AI发现的靶点,分子结构由AI设计,已经在去年6月完成了2期临床试验的首批患者用药,成为了全球首款达到这一里程碑的真正的“AI药物”。

Q7 美迪西:对您而言,您是否相信AI制药会为医药研发行业带来颠覆性的变化?或您是否设想未来人工智能在哪一方面会给药物研发行业更多的助力?

任峰博士:我相信AI制药的潜力。传统的新药研发靠人的知识、经验,这些到达一个巅峰后很难再突破。但AI不同,它没有任何人为偏见,有时候还能给我们眼前一亮的惊喜,并且随着数据量的增加AI会一直进步,甚至是无上限的进步。

目前人工智能为药物研发的赋能主要集中在早期药物发现阶段,也就是我们说的临床前的部分,包括靶点发现、分子设计、合成路线模拟、晶型盐型预测、ADMET性质预测等等。随着数据的规范化和开发开放,我们可以期待看到AI在现在还不能赋能方面,比如毒理性质的预测等发挥作用。在临床阶段,我们也可以期待AI在筛选入组患者,甚至承担对照试验组方面体现价值。

Q8 美迪西:对于AI制药,整个行业以及投资人们的态度是持续在变化的,AI制药概念从一开始受到资本的狂热追捧目前更多投资者会趋于冷静,这对于英矽智能的发展而言会有什么样的挑战?

任峰博士:尽管全球AI赋能在研药物已有超100款,但总体来说,目前AI制药还处在相对早期发展阶段。大多集中在临床1期阶段,最快的也只是在临床2期,尚无AI发现药物获批上市,AI制药还未得到概念性验证,行业对AI制药抱有怀疑,投资趋于冷静都是很正常的事。

我们认为,在AI真正完成全流程的验证之前,开发适合自身的商业模式,是整个AI制药赛道需要面对的最主要的挑战。英矽智能也在不断的探索,从软件合作、药物研发服务、到药物管线对外授权。但再好的商业模式如果无法给公司带来收益,最终也将难以支撑。

2023年英矽智能先后与Exelixis和美纳里尼完成两个项目的对外授权合作,获得了大额的首付款和里程碑付款,使当年的收入实现了显著上升。以这个经验来看,我们认为管线对外授权可能是是公司实现自我造血较为重要的商业模式。

Q9 美迪西:您之前也在美迪西这样的CRO行业工作过,CRO行业的工作经历对于您而言最大的收获是什么?

任峰博士:CRO的这段经历对我的帮助很大,在GSK的十多年工作里,我主要是从事药物化学相关的研发工作的。加入美迪西之后我先主导了化学部的研发服务工作,之后又接手了生物部的研发服务业务,以及美迪西的药物发现平台服务业务。使我有机会接触到早期药物发现各个环节,生物学、化学、CMC、毒理研究等等,对药物发现的端到端流程有了全面直观的了解和介入,这为我加入英矽智能推动临床前药物发现做了非常好的铺垫。

除了对我个人能力的提升之外,因为美迪西的工作经历,使我充分了解和信任CRO的能力,在加入英矽智能之后也更适应和CRO的广泛合作。目前英矽智能和全球包括美迪西在内的40多家CRO达成了不同领域的合作,我们的模式是利用人工智能平台做虚拟筛选,然后由具有经验的生物学家和药化学家做2-3轮的专家反馈,然后交由CRO做湿试验验证。广泛的CRO合作网络,使我们能够在轻资产的情况下快速、及时并高效的推进项目。

关于英矽智能

英矽智能是一家由生成式人工智能驱动的临床阶段生物医药科技公司,通过下一代人工智能系统连接生物学、化学和临床试验分析,利用深度生成模型、强化学习、转换模型等现代机器学习技术,构建强大且高效的人工智能药物研发平台,识别全新靶点并生成具有特定属性分子结构的候选药物。英矽智能聚焦癌症、纤维化、免疫、中枢神经系统疾病、衰老相关疾病等未被满足医疗需求领域,推进并加速创新药物研发。

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